computational chemistry のこと

computational chemistry のことで わかったことを載せます

新薬開発ゲーム 「ドラクエ」 をサポートする化合物データベース

個人向け無料新薬開発ゲーム ドラクエ は、薬剤開発のためのツールです。薬剤設計を楽しむゲームです。
プレーヤーのサポートを私が行います。
具体的には、

ゲームマニュアル
情報交換の場の提供
薬剤ターゲットの追加
新薬設計に役立つ既存薬品データベース 

等を提供します。
ここでは、既存薬品データベース、薬剤ターゲットの情報源を公開します。

既存薬品データベース
SIGMA-ALDRICH社の薬品カタログ
http://www.sigmaaldrich.com/cgi-bin/hsrun/Suite7/Suite/Suite.hjx;start=Suite.HsSubstructureSearch.run?MenuItemName=SubstructureSearch

東京化成工業社の薬品カタログ
http://www.tciamerica.com/cgi-bin/strsearch

↑これらのサイトできること
プレーヤーが設計中の化合物の部分構造を具体的に記入して検索すると、
その部分構造を含んでいる化合物が売っているか?
を調べられる。ただし、その企業が扱っている化合物に限る。無料。

NCBI(National Center for Biotechnology Information)の検索サイト
http://www.ncbi.nih.gov/

医薬品3次元構造database(東京薬科大学薬学部第二薬化学教室)
http://www.pharmis.org/jp/
↑部分構造からの検索可

農薬データベース
http://w-chemdb.nies.go.jp/n_oyaku/n_start.asp
↑部分構造からの検索可

日本化学物質辞書Web(JST科学技術振興機構)
http://nikkajiweb.jst.go.jp/nikkaji_web/pages/top.html
↑部分構造からの検索可

今後、無料の化合物データベースをもっと探して、紹介します。例えば、 
天然に存在する化合物(天然物)
特許化合物(薬を含む)

等に それぞれ特化したデータベース を探します。

薬剤ターゲットの情報源
タンパク質のX線結晶構造データベース
http://www.rcsb.org/pdb/Welcome.do;jsessionid=O4hPkMdfRTnXDcGC-pSEVg**

私が、このサイトから薬剤ターゲットをピックアップします。
私が準備・提供するものは・・ | コメント:0 | トラックバック:0 |
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