大学の研究室様へ2006-07-10 Mon 04:18
本ゲームは、新薬開発ゲームという名前ですが、単なる分子モデリングのツールですので、その範囲内なら何でもできます。
・単に「薬」だけでなく、生命科学実験に必要な 特異的酵素阻害剤の設計 ができます。 ・タンパク質の ホモロジーモデリング ができます。 ・低分子や高分子の 分子力学・動力学計算 ができます（薬などに関係していない系でも可能です）。Discovery Studioには、様々な分子力場パラメーターが納められています。 ですから、大学研究室関係の皆さまが、薬剤ターゲットの提供だけでなく、共同研究の依頼もできるようなシステムに致します。   |
新薬開発ゲームで使える化合物データベースの条件2006-07-10 Mon 03:20
本ゲームでプレーヤーが薬剤設計をする際、化合物データベースが要ります
カテゴリ ゲーム画面・内容 で、化合物データベース（DBと略します）の重要性を述べました。 DBを検索した結果、参考にしたい化合物があったならば、プレーヤーはその化合物構造をダウンロードしたいはずです。 なぜなら、 DB検索で引っかかった化合物構造を、プレーヤー自身が手書きで写し取るのは面倒ですし、ミスします。 よって、利用可能なDBの条件は、 �〔砧繊� ��登録化合物が多い �２醜臺�の部分構造を基にして検索できる �じ〆�でヒットした化合物構造をダウンロードできる �ゥ瀬Ε鵐蹇璽匹靴寝醜臺�構造ファイルが、本ゲームで開ける �ζ探�化合物を検索できる だと考えます。今のところ、� 辞イ両魴錣帽腓�DBは、 日本化学物質辞書Web（JST科学技術振興機構） http://nikkajiweb.jst.go.jp/nikkaji_web/pages/top.html です。 医薬品3D structure DB(東京薬科大学)は、かなり使えそうですが、私のPCでは 化合物部分構造からの検索が上手くできません。よって、使い勝手が確かめられません。 また、農薬DB（http://w-chemdb.nies.go.jp/n_oyaku/n_start.asp） では、化学構造ファイルのダウンロードが できません。 しかし、この程度の小さい分子でしたら、簡単にゲーム中で手書きできます。 手書きできる範囲の化合物 が検索できるDBとしては、試薬屋のOn-lineカタログが便利です。 販売している化合物 で検索できる利点は、とても重要です。 �ζ探�化合物を検索できる これについては、便利な無料サイトを近日中に探して、その使い方や便利性を考察します。この手のDBは、有料 なものがほとんどです。 |
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