computational chemistry のこと

computational chemistry のことで わかったことを載せます

DS Visualizer 1.6 の使い方 -6: タンパク質の圧縮データを解凍する

カテゴリ マニュアル初級編 
の記事中で、無料の分子表示ソフト DS Visualiser をダウンロードしました。

DS Visualizer は、私が無料新薬開発ゲームを作成する際に参考にする 業界ソフト Discovery Studio と酷似しています。
この機会に、使い方を 是非マスターしてください。

本カテゴリでは、 DS Visualiser の使い方  を説明しています。記事は、古い順に是非読み進めてください。

みなさんは、薬剤開発ターゲットである インフルエンザHAというタンパク質を、DS Visualiser で3次元グラフィック表示させようとしています。

そのタンパク質データがゲットできるサイトは、ブログ右上のリンクにあります。 → タンパク質結晶構造DB

そのタンパク質データは圧縮されているので、解凍ソフトが必要です。

本記事では、無料解凍ソフト Lhaplus のダウンロード について説明します。

まず、ソフト紹介サイト 窓の杜 にいきます。
http://www.forest.impress.co.jp/lib/arc/archive/archiver/lhaplus.html

図で説明します。左から右へ見てください

Lhaplus_download1  Lhaplus_download2  Lhaplus_download3
Lhaplus をインストールできましたか?
インストールする際、解凍するファイルの拡張子(ファイル名の後に続く文字:○○.txt だったら、拡張子は txt)を選ぶ画面がありましたら、とりあえず 全部の拡張子にチェックを入れてください。

PCのデスクトップに、Lhaplus のアイコンを置いておくと、便利です。
解凍したいファイルを マウスでドラッグして、Lhaplus アイコンの上に重ねるだけで 解凍してくれます。
無料の3D分子表示ソフト DS Visualiser の使い方 | コメント:0 | トラックバック:0 |

DS Visualizer 1.6 の使い方 -5: タンパク質(毒素やウィルスなど)のモデル表示

本カテゴリで、DS Visualizer の使い方 を説明しています。

タンパク質表示アイコン

これらのアイコンで、毒素やウィルスなどのタンパク質をモデル表示させます。
具体的に、インフルエンザHAタンパク質で示します。

そのために、インフルエンザHAのデータを 
薬剤ターゲット(タンパク質)を見つけるサイト: タンパク質結晶構造DB  で検索して、ダウンロードします。
右上の リンク にあります。

ダウンロードするデータは、ZIP形式で圧縮されていますので、解凍ソフトが必要です。
解凍ソフトは、無料で得ることができます。

次の記事では、まず 解凍ソフト Lhaplus のダウンロード  について説明します。

無料の3D分子表示ソフト DS Visualiser の使い方 | コメント:0 | トラックバック:0 |
| HOME |