チキンから発がん物質−マクドナルドなどを提訴2006-09-30 Sat 17:19
サンスポの記事です 29/09/2006
http://www.sanspo.com/sokuho/0929sokuho010.html チキンから発がん物質−マクドナルドなどを提訴 肉や魚の 焼け焦げ に含まれる発がん物質が、ファストフードの焼いたチキンから検出された として、米国の約６０００人の医師でつくる「責任ある医療のための医師委員会」が２８日、マクドナルドなど食品チェーン７社を相手に危険性の表示を求め、カリフォルニア州地裁に提訴したと発表した。 訴状などによると、カリフォルニア州に店舗があるマクドナルドなど全国チェーン七社の店で販売している焼いたチキンや、チキンを含むサラダなど百点を外部の検査機関で分析したところ、 すべてから発がん物質ヘテロサイクリックアミンの一種ＰｈＩＰ が検出された。 量は１グラム当たり４３・２―０・０８ナノグラム（ナノは１０億分の１）だった。 ヘテロサイクリックアミンは肉や魚を加熱調理すると発生し、米厚生省が２００５年に発がん物質に指定。 ＰｈＩＰについては、カリフォルニア州でもがんを引き起こす化学物質として１０年以上前からリストアップされているという。 医師委員会は、発がんの危険性を客に警告することなしに販売するのは違法だとしている。 一方、マクドナルドは取材に対し「訴状を見ていないのでコメントできない」と回答している。（共同） なるほど。すごい状況ですね。  人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪   |
パーキンソン病治療に光明！？ 新ビタミンと ピーマン・納豆2006-09-29 Fri 20:37
asahi.comの記事です 12/04/2006
パーキンソン病治療に光明!? ピーマンや納豆の含有物質に効能あり 難病であるパーキンソン病の原因とされているタンパク質に、 ピロロキノリンキノン(pyrroloquinoline quinone、PQQ) という物質を投与すると、このたんぱく質の凝集や蓄積が抑えられる(活動を阻害する)効能がある ことが、東京農工大大学院の早出広司教授(生命機能科学)らがつきとめ、4月11日に発表した。 今後細胞レベルでの抑制効果を確認するなどした上で、新薬開発に結び付けたいとしている。 パーキンソン病 とは発症確率0.1％前後の病気で、脳内でドーパミンという神経伝達物質をつくる細胞に異変 が生じてしまい、手足のふるえや歩行が困難になるなどの症状が現れる病気。 タンパク質の αシヌクレインが凝集して細胞に蓄積すること が原因とされている。 教授らは蓄積を防ぐことが発症予防につながると考え、効果のある物質を探したところ、 ピーマンや納豆などに含まれるピロロキノリンキノンが、αシヌクレインの凝集を通常の1割程度に抑える効果があることを発見。 現在パーキンソン病は対処療法しか対応手段が無い。 ピロロキノリンキノンによる治療薬、進行遅延薬が開発されれば、多くの人が救われるに違いない。 ちなみにこの ピロロキノリンキノン（PQQ） という物質、私のBlogで すでに紹介しています。 約半世紀ぶりに日本人が発見した 新ビタミン です。 Nature 422, 832 (2003) Kasahara, T. & Kato, T. サイト 有機化学美術館 http://www1.accsnet.ne.jp/~kentaro/yuuki/mow/0506/pqq.html PQQをサプリメントとして飲める時代が来るかもしれません。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪  |
私事で恐縮です：論文が受理されました2006-09-29 Fri 17:47
Elsevierの科学雑誌
Bochemical and Biophysical Reseach Communications（BBRC） に、私の論文が受理されました。 これで、学位取得の要件をクリアしたことになります（ホッ） 題名は、 Why does avian influenza A virus hemagglutinin bind to avian receptor stronger than to human receptor ? ― Ab initio fragment molecular orbital studies ― です。論文の内容を簡単に説明します。 トリ型 インフルエンザ ウィルスは、トリに強く感染します。 トリ型インフルエンザ ウィルスは、ウィルス自身が持つ ＨＡ というタンパク質の作用で、トリ細胞の表面にあるシアロ糖鎖 という化合物に強く付着できるからです。 ヒト型ウィルスが ヒトに強く感染できる理由も同じです。 ここまでは、すでに知られています。 私が今回報告したのは、 なぜ トリ型インフルエンザ ウィルスのＨＡは、トリ細胞の表面にあるシアロ糖鎖と強く結合できるのか？ という疑問対する答えです。 この論文で使った方法論を発展させていけば、 新型インフルエンザウィルスが持っているＨＡの構造（アミノ酸配列）が解った途端に、そのウィルスは、ヒトに強く感染するのか・しないのか？ 以前のウィルスに比べて強いのか？ といったことが予測できるはずです。薬の開発にも役立つと思います。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
無料ソフトでやる計算化学 リンク追加のお知らせ2006-09-29 Fri 17:19
計算化学の専門家 s2k さんの 計算化学サイト
pc-chem-info を紹介致します。 http://pc-chem.info/ s2kさんは、計算化学の専門家でいらっしゃいます。 特に、無料ソフトを駆使した計算化学 に精通していらっしゃいます。 本サイトにある掲示板では、 計算化学に関する専門的な質問を受け付けており、かなり詳しくアドバイスをしてくださいます。 すごく勉強になります。 私も 今度質問を投稿しようと思います。 その際は、s2kさん 掲示版のみなさん よろしくお願いします。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
Facio のダウンロード2006-09-29 Fri 02:31
無料の3D分子モデル作成ソフト Facio が、次のサイトでダウンロードできます。末永先生が 開発なさっています。
http://www1.bbiq.jp/zzzfelis/Facio_Jp.html 私が企画する 無料の新薬開発ソフトが、 Facio のバージョンUP という形で 実現できれば満足です。 無料の分子力学計算ソフト Tinker は、別のサイトからダウンロードします。 Facio で Tinker を動かすことができます。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
薬剤設計＝タンパク質の機能阻害剤の設計2006-09-29 Fri 02:20
私は、無料の新薬開発支援ソフト を世に出そう と企画しています。
私が企画するソフトでやれることは、 タンパク質の機能を阻害する薬剤の設計 です。 病気の原因になるタンパク質（例えば、ウィルスが持っているタンパク質）の機能を邪魔する化合物は、薬になる可能性があります。 しかし、ウィルスやガン細胞が持っているタンパク質だけを 薬剤開発ターゲット として選定することは、浅はかです。 これまでに、膨大数のタンパク質が報告されています。どのタンパク質も生命現象に深く関わっています。 ある特定のタンパク質の機能を 選択的に邪魔する化合物は、利用価値が 非常にあります。 生命科学の研究にとって、そのような化合物は貴重です。 もしかしたら、万能細胞が ある臓器の細胞に分化する時、特定のタンパク質が沢山発現するかもしれません。そのタンパク質の働きぶりで、細胞の将来（肺の細胞になるのか、腸の細胞になるのか）が決まるかもしれません。 もしそうなら、そのタンパク質の作用を、 新薬開発ソフトで設計した化合物で 一時的に邪魔することで、細胞の将来を人工的に制御できるかもしれません。 この話は、タンパク質の機能を邪魔する化合物の重要性を説明するための例え話です。 タンパク質の機能を邪魔する化合物 を 阻害剤 と言ったりします。 「 阻害剤があったら すごい研究ができるのに 」 と思えるのは、そのタンパク質の機能を熟知した研究者です。 私１人で、すべて調査・理解できるとは到底思えません（もちろん勉強はします）。 結局 言いたいことは、 どんなタンパク質であっても、阻害剤が存在すれば、それは便利でいいことです。 なので、極端な話、 例え 新薬開発ソフトのプレーヤーが、ターゲットタンパク質の機能について無知でも、そのタンパク質の機能を阻害する化合物を設計してしまえばいいんです。 そして、設計した化合物をアップロードする。 こちらから、○○というタンパク質の阻害剤候補化合物の設計ができた と世界にアピールします。そうすれば、 阻害剤が合成したい・欲しい と思っている研究者が訪れるはずです。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
ヨーグルト含有たんぱく質 大腸ポリープを抑制2006-09-28 Thu 18:37
Yahooニュース 読売新聞の記事です 26/09/2006
http://headlines.yahoo.co.jp/hl?a=20060926-00000506-yom-soci 母乳・ヨーグルト含有たんぱく質、大腸ポリープを抑制 母乳やヨーグルトなどに含まれるたんぱく質 ラクトフェリン に、大きくなるとがん化する可能性がある大腸ポリープ（腺腫（せんしゅ））を縮小させる効果がある ことが、国立がんセンターがん予防・検診研究センターの神津隆弘室長らの調査で分かった。 ラクトフェリンは、人間の母乳、特に初乳に多く含まれる。牛乳などにも含まれるが、量が少なく熱に弱い欠点がある。 今回の研究では、牛乳から分離、精製したラクトフェリンの錠剤を使用。 同センター中央病院で、すぐには内視鏡切除の必要がない直径５ミリ以下の腺腫が見つかった１０４人に協力を求め、１日３グラム、あるいは１・５グラムを摂取する群と、ラクトフェリンを含まない偽薬を摂取する群の計３群に分けて、１年後に腺腫の変化を比較した。 牛乳からのラクトフェリンが沢山得られれば 光明ですね。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
TINKERの開発者さんに 問い合わせメール送信2006-09-28 Thu 18:04
無料の新薬ソフト を世に出そうと企画しています。
この企画には、無料の分子力学計算プログラム が必要です。 無料の計算プログラムに Tinker があります。 今日、Tinkerの開発者さん達に 問い合わせのメールを送りました。 Dear Prof. ○× and Tinker co-developers My name is Toshihiko Sawada. I'm Ph.D. student in Gifu University, Japan. I am going to use Tinker program. Thank you very much for releasing excellent free program. I have a question. Please give me some advice. I try to minimize a protein-substrate complex by Tinker program. I have downloaded the complex data from PDB, and then put hydrogen atoms on the complex. In this case, which force field parameters should i select ? Do you have a program for putting automatically atom type ? Kind regards, Toshihiko Sawada Ph.D. Student, Department of Applied Bioorganic Chemistry, Gifu University, Japan 返信が楽しみです。無視されませんように・・。 まずは親密になるように努力します。 そして、問題を克服する手助けを頂戴します。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
アルツハイマー病予防・治療剤・飲食物2006-09-28 Thu 17:55
科学技術振興機構(ＪＳＴ)の研究成果データベースからです
http://jstore.jst.go.jp/cgi-bin/prompt/detail.cgi?prompt_id=4970&from=all_search&keyword=%cc%f4%ba%de&select_keyword=1 公開番号 未公開特許 出願番号 特願2006-029255 出願日 2006年2月7日 発明の名称 アルツハイマー病予防又は治療剤、並びに飲食物 出願人／権利者 筑波大学 技術概要 発明者らは、コーヒーの成分 である２個以上のカフェ酸がエステル結合した構造を持つ カフェオイルキナ酸 が、アミロイドβタンパク質による神経細胞死を抑制する ことを新規に見いだした。 本発明ではこの化合物を含む薬剤や飲食物をアルツハイマー病の予防又は治療に有用な予防機能性食品として用いる。 長期間、連続的に適用できる可能性が高い、副作用の少ない可能性が高いなどの利点がある。 なるほど。すごいです。 詳しい情報は、この記事に記載したサドレスに行って見てください。 ライセンスの交渉等ができるそうです。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
私は賛成です → ＜伊吹文科相＞英語必修に慎重な考え示す2006-09-28 Thu 09:19
Yahooニュース 毎日新聞です
http://headlines.yahoo.co.jp/hl?a=20060927-00000109-mai-pol ＜伊吹文科相＞英語必修に慎重な考え示す 次期学習指導要領に盛り込まれる見通しの 小学校５年生以上の英語必修化 について、伊吹文明文部科学相は２７日、 「必須化する必要は全くない。まず美しい日本語が書けないのに、外国の言葉をやってもダメ」 と必修化に慎重な考えを示した。文科省が実施した市民からの意見募集でも必修化に消極的な意見が約４割を占めており、今後論議を呼びそうだ。 伊吹文科相は、英語教育よりも最低限の素養や学力を身につけさせることが先決だという認識を示した。さらに中央教育審議会が英語必修化を答申した場合について、「中教審のお考えを入れるか入れないかは、私が判断をしなければいけない」と述べた。 私は、伊吹大臣に賛成です。 科学の視点から考えても賛成です。 私も以前は、「大学の自然科学の講義は 英語で講義したほうが勉強になる」 という感じに思っていました。 しかし、ある先生と喫茶店で雑談した際、 Scienceを英語以外の言語で教育している国として、日本は かなり成功しているほうだ という話題になりました。 なるほど！ と思いました。 微妙なニュアンスを学ぶのに、いきなり 母国語じゃない第二言語でやると非常に理解に苦しむ場面があると思います。 「 OH group 」 を 「 OH基 」という日本語に翻訳した日本人先生は、素晴らしいセンスだと思います。 伊吹大臣が言う 美しい日本語 を、私は書けません。とても恥ずかしいです。 私の 爺さん婆さん世代 では、達筆な方が ほとんどです。楷書、草書どちらも すさまじく上手です。 神風特攻隊で散った若い軍人さんの遺書を見ても、すべて達筆です。 戦争うんぬんに関わらず、尊敬してしまいます。その意味では、あの頃の教育は すごくいいと思います。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
新たな 低分子化合物データベース を見つけました2006-09-27 Wed 23:57
無料の新薬開発ソフト を世に出そうと努力しています。
カテゴリ 私が準備・提供するものは・・ の過去記事 新薬開発ゲームで使える化合物データベースの条件 カテゴリ ゲーム画面・内容 の過去記事 新薬開発ゲームの やり方・遊び方は！？（インフルエンザ新薬開発を例に） の後半 で、無料の新薬開発ソフトを使う際、無料の低分子化合物データベースがあると便利だ と言いました。 私が企画する無料ソフトは、末永先生の 無料ソフト Facio の機能を充実させることで作ろうと思っています。 そのために、PDB形式の構造データ がダウンロードできる低分子化合物データベース（無料）があると便利です。 しかし、そういうデータベースが なかなか見つかりません。 その代わりなんですが、内容が濃い 無料低分子化合物データベース を新たに見つけました。 その名も・・・ データベース名やサイトアドレスが知りたい方は、メールファームからメールを送ってください。お知らせ致します♪ データベースは 無料です。約270万の化合物データがあるそうです。薬というより、低分子化合物全般です。 構造式からでも類似構造検索ができます。構造データのダウンロードも出来ます。ただし、pdb形式ではないです。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
PDB形式の化合物データベース（無料）を どうか教えてくださいませ2006-09-27 Wed 18:22
無料の新薬開発ソフト を世に出そうと努力しています。
カテゴリ 私が準備・提供するものは・・ の過去記事 新薬開発ゲームで使える化合物データベースの条件 カテゴリ ゲーム画面・内容 の過去記事 新薬開発ゲームの やり方・遊び方は！？（インフルエンザ新薬開発を例に） の後半 で、無料の新薬開発ソフトを使う際、無料の低分子化合物データベースがあると便利だ と言いました。 無料のデータベースで、この構造データをダウンロードできるものは、少ないです。 ダウンロードできる構造データにも、品質の良し悪しがあります。 場合によったら、データをダウンロードするよりも、手書きで写した方がいいです。 出来る限り、PDB形式の構造データ がダウンロードできる低分子化合物データベース（無料） を探します。 みなさま ご情報を くださいませ。 場合によったら、コツコツ自分でも描いて作ろうと思います。 データベースを無料公開されている 皆様方に ご協力を お願いに参ろうと思います。 もちろん市販のデータベースに勝とうとは思っていません。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
アトピー性皮膚炎の新薬タクロリムス＝移植免疫抑制剤2006-09-26 Tue 18:39
アトピー性皮膚炎の新薬タクロリムス軟膏剤・移植免疫抑制剤
http://www.caloricdiet.com/special/articles/tacrolimus.html タクロリムス軟膏剤は、アトピー性皮膚炎の治療に、ステロイドなどの副作用もなく大変有効な薬であるそうです。 タクロリムス (Tacrolimus)は、臓器移植の際に拒否反応を防ぐ免疫抑制剤としてステロイドなどとともに使用されていました（アメリカFDAの正式認可は1994年）。 この新しい薬を、アトピー性皮膚炎の治療に使えないか と、世界各国の皮膚科の先生が臨床試験しました。 この薬は、日本の藤沢薬品工業のアメリカ法人が開発したそうです。 日本皮膚科学会から タクロリムス軟膏剤 の説明 http://www.dermatol.or.jp/member/oshirase_031024.html タクロリムス軟膏（商品名：プロトピック軟膏，藤沢薬品工業（株））は，1999年11月より，日本で世界に先駆けて大人（16歳以上）のアトピー性皮膚炎治療薬として使用されるようになりました。 約4年を経て，世界数十カ国でアトピー性皮膚炎の治療に大変役立つお薬として，広く使用されるに至っています。 また，2003年12月よりは，小児（2〜15歳）のアトピー性皮膚炎の患者さんにも濃度を薄くした小児用のものが使用されるようになりました。 しかし，今回小児用のお薬の使用に際しては，メディア報道を含むいろいろな情報が飛び交い，患者さんの間で一部に混乱が生じているようですので，当学会の考え方について，以下にご説明します。 ★はじめに 今回小児用のタクロリムス軟膏の発売に際して，厚生労働省から使用する医師に対して，以下のことを患者さん及び保護者の方にご説明して納得していただいたうえで使用することが義務づけられました． １．マウス（実験用のネズミ）にこのお薬を長期間塗り続けるという実験で，高い血液中の濃度が長期に続いたことより，リンパ腫という癌の増加がみられたこと． ２．この薬との関連ははっきりしていないものの，外国において，この薬を使用中にリンパ腫と皮膚癌がみられたことが報告されていること． １については，アトピー性皮膚炎の患者さんが 決められたルールにしたがって使用していれば，「高い血液中での濃度が長期に続く可能性」は極めて低いことがこれまでのデータから明らかにされています． ２については，日本では，この薬を使用した患者さんでのリンパ腫，皮膚癌の発生は，これまでにみられていません（2003年9月現在）。 海外では，この薬の使用との関連が完全に否定されないと判断された例が，リンパ腫，皮膚癌ともに3例づつ報告されています。 逆に，この薬との関連が強く疑われた癌の発生は，今のところ1例もありません（2003年9月現在）。 この薬は世界中で既に少なくとも数十万人の患者さんに使用されていることより，それぞれの3例の発生は，自然にこれらの癌が発症する確率を超えるものではないと考えられます。 なるほど。いい薬です♪ 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
教えてくださいまして、真にありがとうございます2006-09-26 Tue 18:13
薬剤特許について、
（株）ホーライ製薬の ホーライさん http://www.geocities.jp/horai_seiyaku/ 薬作り職人さん http://kentapb.blog27.fc2.com/ http://3.csx.jp/kenta_k/ が、私に丁寧に教えてくださいました。 真にありがとうございます。 これからも 努力します！！ 追加で教えてくださる方がいらっしゃいましたら 是非コメントをください。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
急性骨髄性白血病の新薬 ゲムツズマブオゾガマイシン2006-09-26 Tue 10:30
急性骨髄性白血病 の 新薬 ゲムツズマブオゾガマイシン
とりあえず、記事の原文を載せます。後半では、記事の内容を 分かりやすく説明します。 参考サイト suzuken http://medical.radionikkei.jp/suzuken/final/060420html/index.html 読売On line 28/11/2005 日本薬理学会誌 http://www.jstage.jst.go.jp/article/fpj/124/1/124_25/_article/-char/ja この薬は、細胞傷害作用を有する抗腫瘍性の抗生物質であるγ-カリケアマイシンの誘導体としてヒト化抗CD33モノクローナル抗体を化学的に結合させたもの。 再発 又は 難治性 の CD33陽性の急性骨髄性白血病治療薬 だそうです。 モノクローナル抗体を抗癌剤のキャリアとして利用した世界で最初の薬剤です。 カリケマイシンは土壌菌から遊離されたカリケアマイシンファミリーの一つであり、抗CD33モノクローナル抗体はマウスの抗CD33モノクローナル抗体を遺伝子組み換え技術によって、ヒト化したIgG4抗体です。 両者はリンカーで結合し、循環血中では開裂せず、白血病細胞の表面に発現するCD33抗原に結合し、細胞内に取り込まれた後に、カリケアマイシン誘導体が遊離して抗腫瘍効果を発揮します。 下の図が ゲムツズマブオゾガマイシン の構造です。  難しい内容ですので 噛み砕きます。 この薬は、カリケアマイシン誘導体と、抗CD33モノクローナル抗体が結合している化合物です。 カリケアマイシンは、細胞のDNAを壊して細胞を殺す働きがあります。何の工夫もしなければ、正常な細胞まで殺してしまいます。 抗CD33モノクローナル抗体は、白血病細胞のみ に結合します。 カリケアマイシンと、抗CD33モノクローナル抗体を結合させてれば、白血病細胞のみに カリケアマイシンを作用させることが出来ます。 この薬は、白血病細胞に接触するまでは分解しません。もし、分解してしまったら、正常細胞まで殺してしまいます。 細胞にとっての猛毒を適所（白血病細胞）に送り届ける ということです。 モノクローナル抗体をドラッグデリバリーに応用した世界初の薬剤らしいです。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
薬剤ターゲット（タンパク質）の加工2006-09-25 Mon 22:53
私は 無料の新薬開発ソフト を世に出そうと努力しています。
薬剤ターゲットは タンパク質分子 です。例えば、コレラ菌の毒素などです。 薬剤ターゲットは、 カテゴリ 薬剤ターゲットの紹介 に、今後も追加していきます。 薬剤ターゲットであるタンパク質は、リンクにもある タンパク質結晶構造データベース（PDBと略す） で、私が探します。 しかし、PDBから得たデータには、水素原子が付加されていません。 なので、水素原子を自動付加するプログラム が必要です。 Reduce という 水素原子自動付加プログラムが公開されています。 http://kinemage.biochem.duke.edu/software/reduce.php 参考にすると思います。勉強します。 DS Visualizer では、クリック１つで 自動に水素原子の付加ができます。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
インフルエンザ薬 タミフルの話２2006-09-25 Mon 22:18
以前に、このカテゴリで インフルエンザ薬 タミフル の話をしました。
今回は、タミフルの構造 を DS Visualizer で見ます。 DS Visualizer は無料ソフトで、ダウンロードの仕方は、 カテゴリ ゲームマニュアル の過去記事 マニュアル 初級編 I-�◆〔瑤鮴賤僖愁侫箸妊哀薀侫�ック表示する で、紹介しています。 タミフル (Tamiflu)は商品名です。実際の薬名は、リン酸オセルタミビル だそうです。スイスのロシュ社（日本ではロシュグループ傘下の中外製薬）が販売しているインフルエンザ薬です。 参考サイト wikipedia http://ja.wikipedia.org/wiki/%E3%82%BF%E3%83%9F%E3%83%95%E3%83%AB インフルエンザウィルスは細胞内で増殖した後、細胞を壊して外に出ます。外に出る時に、ウィルスが持っている ノイラミニダーゼ という酵素が働きます。 タミフルは、ノイラミニダーゼの働きを邪魔します。 現在タミフルは、中華料理で香辛料に使われる、トウシキミの果実である八角の成分シキミ酸を原料に、10回の化学反応を経て生産されているそうです。 2006年、E.J. Corey 先生によってブタジエンとアクリル酸を[1]、柴崎正勝先生によって 1,4-シクロヘキサジエンを出発物質とする[2]オセルタミビルの全合成法が報告されています。 [1] Yeung, Y.-Y.; Hong, S.; Corey, E. J. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 6310–6311. [2] Fukuta, Y.; Mita, T.; Fukuda, N.; Kanai, M.; Shibasaki, M. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 6312−6313. 実際に リン酸オセルタミビル：Oseltamivir phosphate （タミフル）の構造データをダウンロードします。 リンクにもある 日化辞web に行ってください。 http://nikkajiweb.jst.go.jp/nikkaji_web/pages/top.html 検索後に Oseltamivir phosphate と入れて検索しても、構造データは得られませんでしたので、oseltamivir で検索し直してください。 すると、検索に引っかかります。下の図を左から見ながら、構造データをダウンロードしてください。    私の場合は、J871_765F.mol というファイルがダウンロードできました。 DS Visualizer でこのファイルを開けば、構造が見れます。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
新薬開発ソフトに 『 分子の重ね合わせ機能 』 は必須2006-09-25 Mon 20:36
無料の新薬開発ソフト にとって、分子重ね合わせ機能 は、とても重要です。
プレーヤーは、薬剤を設計した後に その薬剤を、薬剤ターゲットであるタンパク質の鍵穴に はめ込みます。 もともとは、薬剤ターゲットタンパク質には、基質が はまっていました。基質があった場所に、設計した薬剤化合物を置くわけです。 方法ですが、まず、基質の上に薬剤分子を重ね合わせる。次に、基質を削除する。 末永先生の 無料ソフト Facio には、「分子重ね合わせ機能」が、すでに実装されています。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
温暖化→気温上昇→伝染病拡大 の可能性 EUのレポート2006-09-24 Sun 22:48
NEDOの海外レポートです。
20/09/2006 温暖化による気温上昇が伝染病を増加させる危険性（EU） 中世のヨーロッパでは、ペスト が猛威を振るったことがあります。 現在でも、猛威とまではいかないが、東ヨーロッパ、旧ソ連、南米、東アジアの一部で発生している。 ペスト菌は、ネズミに寄生するノミ が介して蔓延する。 研究の結果、 ・春に1℃気温が上昇すると、ペスト菌が50%増える可能性がある こと ・気候変動によって、中世のペストの再来はない こと ・わずかな気温上昇でペストが今よりも増える可能性があること を報告しています。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
私がこの企画で意図すること ・ しないこと2006-09-24 Sun 22:29
私は、無料の新薬開発ソフトを世に出したい と企画・活動しています。
無料の新薬開発支援ソフトがあったら便利だと 単純に思ったのが最初です。 企画の意図ですが、この一点につきます。 お金がなくて実験設備・試薬が買えない人でも、無料の新薬設計ソフトならば、興味がありさえすれば とりあえず 試してみようかと思う。 無料ソフトなら 形から入ることができる。ソフトを使いながら、勉強すればいい。 アマチュアサイエンティスト・中高生だって、医薬分野に興味があるヒトはいる。同様に形から入ることができる。 自分自身も、無料ソフトなら使ってみたいと思う。 教育界のかたへ 別に 実体験に基づいた科学教育を 批判しているのではありません。 自然体験学習・科学マジック 等も是非やってください。 数ある科学教育方法の１つとして、ＰＣによる新薬設計があってもいいと思います。でも万人に押し付けるわけではありません。 ＰＣの中だけのバーチャル世界なのでイヤ という方は、無理にやらなくていいと思います。私の夢としては、実際の化合物を扱う方々・生理活性を研究する方々を巻き込めるシステムにします。 理系高校生には、企業や大学研究室での体験実験などがやれると、面白いと思います。最先端科学に触れた時の一種の感動は、科学マジックなどでは味わえないと思っています。 無料ソフトの開発自体が無理だと思うかたへ 私が企画するのは あくまでも無料ソフトです。公開初期の段階で、高価な市販ソフト並みの機能を全て実装するつもりはないです。それでも、ソフトのアップデートは定期的に行うつもりです。 無料で科学系ソフトを公開していらっしゃる先生方は、意外なほど世界中にいます。協力してもらえると思っています。 ゲーマーのかたへ プレーヤーが、新薬開発ゲームをゲームとしてつまらないと思えば、自由に止めることができます（当たり前ですね）。 また、新薬開発のどこにゲーム性を持たせるか？ という問題があります。何とかできると思っています。 今言えることは、新薬開発ゲームで得た情報は商材にできる ということです。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
いまや双方向に 酵素の反応2006-09-24 Sun 22:11
Science 2006, Vol.313, 1291-1294.の論文です。
Exploiting the Reversibility of Natural Product Glycosyltransferase-Catalyzed Reactions 生命現象は、生体内での色々な化学反応によって支えられています。 その反応は、酵素 というタンパク質の作用によって、効率的に起きます。 酵素の中に、糖転移酵素 というものがあります。糖転移酵素は、○○という化合物のみに「糖」という物質をつなげる反応 を手助けします。 化学者は、今まで 「糖転移酵素は、○○に糖を繋げる反応のみを手助けする」と考えてきました。 この論文では、糖転移酵素が その逆反応も手助けする ことを報告しています。 この場合の逆反応とは、「○○から糖を切り離す反応」です。 時と場合によっては、相反する化学反応を手助けしているようです。 酵素による生体内反応の既成概念を揺さぶる報告です。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
『無料の新薬開発ソフト』の実現に向けて 非常に大きな進展2006-09-24 Sun 19:35
私が企画する 無料新薬開発ソフト の実現に向けて 非常に大きな進展がありましたので お知らせします。
無料の化学計算インターフェイス Facio の開発者でいらっしゃる 末永正彦 先生 （九州大学理学研究院 化学部門） が、無料新薬開発ソフトの開発に 協力してくださいます。 本当に本当にありがとうございます。 また、私のBlogで 先生のご紹介文を掲載することも 快諾してくださいました。重ねて御礼を申し上げます。 Facioは、私の企画に必要な 化学計算ソフト TINKER にやさしいインターフェイスです。なので、思い切って末永先生にアプローチしました。 一学生にすぎない私の話を 真摯に聞いてくださいまして、真にありがとうございます。 自分の思いが伝えられて ほっとしています。 末永先生は、化学計算・分子のグラフィック・プログラミング のどれもに精通していらっしゃる先生です。 私にとって 救世主的な先生です。 特にプログラミングの作業は、非常に重要な上に骨が折れる作業です。 私は、プログラミングの素人です。申し訳ありません。 なんとか このプログラミング分野で 協力してくださる方を これからも探そうと思います。 TINKERの開発者 Prof. Robert Paine, Chemistry Dept., Univ. of New Mexico には、連絡を取ります。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
食べるワクチン アルツハイマー病に対して2006-09-24 Sun 17:59
さきがけonWebの記事です
23/09/2006 http://www.sakigake.jp/p/news/science_list.jsp 食べるワクチン動物で効果 アルツハイマー病 アルツハイマー病 の原因物質とされるタンパク質 ベータアミロイド の 遺伝子 を ピーマン に組み込み、その葉を食べさせることで脳に蓄積したベータアミロイドを約半分に減らすことに、東京大の石浦章一（いしうら・しょういち）教授（分子認知科学）らが２３日までに、マウスで成功した。 葉の中にできたベータアミロイドが腸から吸収されることで、体内の抗体が増える仕組み。 ベータアミロイドを直接注射する人間の臨床試験では髄膜炎が出た例があるが、今回のものは経口ワクチンで、副作用は出なかったという。 人間で安全性と効果が確かめられれば「食べるワクチン」開発につながる可能性がある。 アルツハイマー病は、脳にたまったベータアミロイドが神経細胞を死滅させ、記憶や認知障害などの症状が出ると考えられている。 石浦教授によると、ベータアミロイドの精製は難しいため、ピーマンに遺伝子を導入して作らせるようにした。 育った葉を細断し、家族性アルツハイマー病のマウス６匹に週１回、３カ月間食べさせたところ、脳のベータアミロイドは、食べさせなかったマウスに比べて平均で約半分に減少。 血液中の抗体の量は、食べる前より増えていた。 石浦教授は「自然に老化したマウスにも効けば、アルツハイマー病では患者が最も多い原因不明の孤発性にも効果が望める」と話している。 すご過ぎる研究ですね。 ベータアミロイドが胃や腸で分解されずに 腸で吸収されて、ベータアミロイド抗体が作られる。その抗体が、脳に溜まったベータアミロイドが減る→アルツハイマー病の原因物質が減る。 すごい。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
ＮＨＫの サイエンスZERO 私は科学マジックよりも面白いと思います2006-09-24 Sun 01:25
私は、NHKの サイエンスZERO という番組は好きです。（結構見逃しますが；）
http://www.nhk.or.jp/zero/ 科学マジックよりも面白いと思っているのは私だけでしょうか？ もちろん 科学マジックをやるな という意味ではありません （すみません 誤解しないでください）。 NHKの 学校デジタルライブラリー も、かなりcoolだと思います。 http://www.nhk.or.jp/clip/ もちろん自然体験学習も賛成です。 でも、ミジンコとか細胞の動画は、かなりすごいです。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
私の企画に対する ご批判2006-09-24 Sun 01:08
私の企画する 無料の新薬開発ソフト について、
@nifty:化学の広場 という掲示板の 【化学教育】放課後の準備室 に投稿したことがあります。 このサイトの左端に【化学教育】の掲示板があります。 http://fchem.nifty.com/ 中高生 特に高校生くらいになると、理系文系の選択をします。 理系高校生にとって、最先端科学の薬剤設計がＰＣ１つで無料体験できる私の企画は、科学教育の１つの方法としていいのではないか？ 高校生が「○○の研究がしたいので△×大学に入りたい！」と思えるような状況を作れないか？ と思って投稿してみました。 ですが、反応は非常に厳しかったです。具体的には、こんな批判がありました。 ・PCでバーチャル体験のみなんて全くダメ。実体験（自然体験学習、科学マジック、普段の理科実験）を先ずやれ。別に 最先端科学じゃなくても科学教育はできる。中高生には良くない。大学生・院生にはいいかも。 ・薬剤設計のみで、実際の薬理効果を調べないのだから無意味。薬剤設計でゲームとは何事だ！？臨床や治験といった地味ながら大切な作業があるから薬に成るのだぞ。なめているのか！？ ・無料新薬開発ソフト自体が作れるはずがない。新薬開発ソフトが高価なのは、それなりの理由がある。 ・薬剤設計は専門知識があって初めてやれる。素人には無理。 ・ゲームとして成立たない。プレーヤーは、すぐに飽きるだろう ・誹謗中傷（悲涙） なるほど そうかもなぁという批判もあります。勉強になります。 このような指摘があると、自分の目指す方向性が 絞れてきます。 そして、何をもっと説明すべきか はっきりしてきます。 近日中に、次のことをBlogに載せます。 ・私がこの企画で意図すること 及び 意図しないこと ・無料新薬開発ゲームでやれること・やれないこと 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
歯垢を分解する糖類 花王研究所2006-09-24 Sun 00:16
asahi.comサイエンスの記事です。
23/09/2006 http://www.asahi.com/science/news/TKY200609220322.html 歯垢を分解する糖類、果物やワインに 花王研究所が発見 果物やキノコ、ワインなどに含まれている糖類の一種「エリスリトール」に、虫歯や口臭の原因となる歯垢（しこう）を分解しやすくする働きがあることを、花王の研究者らが見つけた。 歯ブラシやうがいの水流程度 でも、歯垢がはがれやすくなる ような効果が期待できるという。 ２２日に横浜市で始まった歯科基礎医学会で発表した。 口の中には虫歯につながる病原菌と、いわゆる善玉の細菌などが混在する。こうした細菌が増えて、食べかすなどをエサにして絡み合い、歯につくと、取れにくい歯垢となる。 唾液（だえき）の清浄作用が細菌の増殖を抑えることは知られているが、詳しい仕組みは分かっていないという。 唾液の働きを研究していた花王ヘルスケア研究所の前田晃嗣室長、矢納義高主任研究員らは、メロンやナシなどの果物や、しょうゆ、みそ、ワインなどの発酵食品に含まれるエリスリトールが、唾液と同じように細菌同士の結合をゆるくする働きを持つことを見つけた。 再現した歯垢にエリスリトール水溶液をかけると、歯ブラシが触れなくても、ブラシが起こす水流を再現した超音波があたるだけで、歯垢がはがれるようになった。 エリスリトールを使わずに超音波をあてるのに比べ、歯垢は約３分の１まで減っていた。 なるほど。面白い研究成果ですね。花王製のハミガキに「エリスリトール配合」の広告が踊る日は いつ頃でしょうか？ 楽しみです。 また、私は 唾液 の詳細な研究にも興味を持ちました。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
最古の子供の化石 エチオピア2006-09-23 Sat 14:51
読売On Lineの記事です
21/09/2006 ３３０万年前、最古の子供の化石…エチオピアで発見 子供のものとしては人類最古 となる約３３０万年前の 猿人女児 の頭骨など全身にわたる化石を 独マックスプランク研究所 や 米南フロリダ大 などの国際チームがエチオピアで発見。 ２１日付の英科学誌ネイチャーに掲載される。 猿人は人類の最も初期の段階だが、今回の化石では「人類の証し」とされる２足歩行をしていたことを示す足のほか、樹上生活に優れていたとみられる、ゴリラなどの類人猿に似た指や肩の特徴の双方が確認できた。 初期の人類の成長過程を探る貴重な資料だ。 化石は同国北東部で２０００年末〜０３年末に発掘された。 約３００万〜４００万年前の「アファール猿人」の女児とみられ、３歳くらいと推定される。 発見されたのは、頭骨のほか、手の指、右肩、両ひざなど。特に、古人類化石としては２個目となる舌の付け根の舌骨も含まれ、この分析には京都大学理学部の西村剛博士が協力した。 乳歯はすべて生えそろい、ＣＴ画像には、ほぼできあがった臼歯（きゅうし）などの永久歯があごの内部にできている様子が確認され、これらの状態で年齢を推定。 脳容積は同年齢のチンパンジー並みの３３０ｃｃだった。 子供の化石は、脳の発達や大人への成熟など、人類進化の解明に特に重要だが、小さくもろいこともあって、発見されるのは非常にまれ。 女児の死因とみられる洪水で、急速に土砂で埋められ、風雨にさらされずに良好な状態で化石化したと推測されている。 南アフリカ共和国で見つかった２５０万年前のアフリカヌス猿人の頭骨がこれまで最古だった。 ところで、『 昆虫の化石 』って報告例がありましたっけ？ 全く無かったと思いますが いいかでしょう？ ご存知の方 いらしたら どうか 教えてくださいませ。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
無料新薬開発ソフトは登録制にします2006-09-23 Sat 14:31
私が企画する 新薬開発ソフト は、 無料 ですので、 どなたでも ダウンロードして使えるようにします。
英語版でも公開したいです。 ですが、ダウンロードは 登録制 にするつもりです。 また、最低でも1年に1回は、ソフトのアップデートを兼ねた登録確認も行いたいです。 本名、電話番号、住所、所属（学校名や会社名）、e-mailアドレス、得られた結果に関する権利 などに記入・サインすることで、ダウンロードできるようにします。 記入事項等の詳細は、まだ決めていません。 これらの対応は、私が それだけ真剣にやっている・長期間継続してサポートする という証でもあります。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
ゲームマニュアル 初級編 II -6: pseudo-Gb3 を描く2006-09-23 Sat 00:18
本カテゴリで、新薬開発ゲームのマニュアル を公開しています。
それなりに難しいですが、具体例を挙げながら説明しています。 古い記事から読み進めてください。 内容が繋がっています。 質問がありましたら、ご遠慮なく お寄せください。 本カテゴリでは、無料の分子グラフィックソフト DS Visualizer を使っています。 このソフトの得る方法は、本カテゴリの過去記事 マニュアル 初級編 I-�◆〔瑤鮴賤僖愁侫箸妊哀薀侫�ック表示する で紹介しています。 本カテゴリの前回記事までに、 マニュアル 初級編 II. Gb3に似ている化合物「pseudo-Gb3」の設計方法 ��-OH基（ヒドロキシ基と読む）は、-SH基（チオール基）-NH2基（アミノ基）と似ている。 ��6員環は、ベンゼン環と似ている。 ��pseudo-Gb3 を設計してみる。 を説明してきました。 今回の記事から、��pseudo-Gb3 を設計してみる。 を説明していきます。 pseudo-Gb3とは何ぞや？ と思われた方は、 カテゴリ ゲーム画面・内容 を読んでください。 私が 新薬開発ソフトで設計した薬として、pseudo-Gb3が登場します。 本題に入ります。 まず、pseduo-Gb3 を DS Visualizer で描いてみます。 pseudo-Gb3 は、下図の構造です。これを描きます。  実際の作業手順を示します。 Visualizer を起動し、『 File 』→『 new 』→『 3D window 』 とクリックして、何も描いてない画面を表示させます。 次に、下図を左から右に見てください。   これは、まだ作業の途中です。中断したい時は、データをsaveします。 Visualizerの画面左上 「File」→「Save as」→「Viewer Files(*.msv)」 を選び、自分の好きなファイル名で保存してください。 私の場合は、pseudo_Gb3 と名付け、pseudo_Gb3.msv というファイルができました。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
ロボット専門病院が「治療」開始2006-09-22 Fri 22:36
ashi.comの記事です
ロボット専門病院が「治療」開始 http://www.asahi.com/special/robot/OSK200608310046.html 31/08/2006 ロボットのための専門病院「ロボクリニック」（大野一広院長）が、大阪市内にオープンした。 受診の対象は 市販されているほぼすべてのロボット で、世界的に珍しい試みという。 初診料は、見積料金込みで５０００円。“入院患者”第１号となる身長約３０センチの二足歩行ロボットが３０日、東京都文京区から宅配便で到着し、治療がスタートした。 修理を受け持つ「一般治療科」と、動作プログラムなどの改良を行う「リハビリ科」の二つ。 院長でロボット技師の大野さんのほか、機械工学や制御プログラムなどが専門の技術者３人が非常勤ドクターを務める。 市販ロボットでよく見られる故障は、駆動モーターの不具合、配線切れ、フレームの破損など。 修理用部品の調達に時間がかかるものを除き、入院期間は最長でも１週間程度にとどめ、できるだけ早く所有者のもとに返す方針という。 すごい発想です。とても面白いと思います。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
マラリア制圧へ「ＤＤＴ」を使用せよ…世界保健機関の訴え2006-09-22 Fri 13:46
読売on lineの記事です。16/09/2006
マラリア制圧へ「ＤＤＴ」使用拡大訴え…世界保健機関 世界保健機関（ＷＨＯ）は１５日、ワシントンで記者会見を開き、 「マラリア制圧のため、ＤＤＴの屋内噴霧を進めるべきだ」 と発表した。 ＤＤＴは、生態系に深刻な悪影響を及ぼすとして１９８０年代に各国で使用が禁止された殺虫剤だが、 ＷＨＯは 「適切に使用すれば人間にも野生動物にも有害でないことが明らかになっている」 と強調、 ＤＤＴの“復権”に力を入れる方針を示した。 マラリアの病原体は、熱帯の蚊によって媒介される。ＤＤＴの散布によって激減に成功した国もあったが、その使用禁止とともに再び増加。 最近は世界で毎年、５億人以上がマラリアに感染し、１００万人以上が死亡しているという。 ＷＨＯマラリア対策本部長の古知新（こち・あらた）博士は 「科学的データに基づいた対策が必要だ。安全な屋内噴霧剤としてＷＨＯが認めた薬剤の中で、最も効果的なのがＤＤＴだ」 と説明した。 ＷＨＯによると、１０か国でＤＤＴの屋内残留噴霧が行われている。 以前 本カテゴリで、『サイドマイドが薬になる』と紹介しました。 適切な使用量 と 適切な使用時期・場所 さえ管理すれば、悪名高い DDT だって 利用価値がかなりあるということでしょうか。 DDTで言えば、『屋内噴霧での使用』が重要だと私は考えます。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |