DS Visualizer 1.6 の使い方 -7: タンパク質構造データベースからインフルエンザをダウンロードする2006-09-04 Mon 13:32
本カテゴリでは、 DS Visualiser の使い方 を説明しています。記事は、本カテゴリの古い方から順番に読み進めてください。内容が繋がっています。
みなさんは今、DS Visualiserを使って、薬剤開発ターゲットである インフルエンザHA の三次元構造をグラフィック表示させようとしています。 今から、インフルエンザHAの構造データを、タンパク質構造データベースからダウンロードします。 ダウンロードするファイルは、圧縮されていますので、解凍ソフトが必要です。前の記事で、無料解凍ソフト Lhaplus を得ています。 さっそく、本BLOGのリンクにある 薬剤ターゲット（タンパク質）を見つけるサイト： タンパク質結晶構造DB をクリックして、サイトへ移動してください。このサイトのことを、PDBと今後呼びます。Protein Data Bank の略です。 検索・ダウンロードの仕方を図で説明します。図は、左から右に見てください。     インフルエンザH5の圧縮データファイル が ダウンロードできましたか？ できましたら、そのファイルを デスクストップにあるアイコン Lhaplus の上にドラッグして重ねてください。 自動的にファイルが解凍されます。 無料解凍ソフト Lhaplus については、本カテゴリの過去記事 DS Visualizer 1.6 の使い方 -6: タンパク質の圧縮データを解凍する を見てください。   |
科学屋さんのサイト 『 サイエンスな日々』2006-09-04 Mon 10:23
科学屋さんのサイト→ サイエンスな日々
をリンクに追加しました。 科学全般の最新話題が満載です！ 面白いです。 これからも 遊び and 勉強しにいきます♪ |
アマチュアサイエンティストのみなさんへ2006-09-04 Mon 10:21
アマチュアサイエンティストのみなさんに お伝えしたい論文があります。
BLOG 中学生からの作文・論文 から引用します。 http://blog.z-abc.com/?day=20060701 30/06/2006のScienceに掲載されている論文です。 アリ体内に”歩数計” 巣穴までの距離 正確把握 （結論） アリは、歩数を数えることで、移動距離を正確に把握している可能性の高いことをドイツのウルム大などの研究チームが突き止めた。体内に”歩数計”を持っていることを示す成果。 （問い） アリは、巣に戻る方向を光で探る。しかし、巣までの距離をどう把握しているのかは謎だった。 （答え=仮説） 研究チームは、距離測定は歩数で行うとの仮説を立て、アフリカのサハラ砂漠に生息するアリの脚の長さを変えて、実験した。 （方法） 巣穴から１０メートル離れた場所でエサを与えたアリを、�．屮燭量咾鮹歿呂里茲Δ僕�かせて、脚を長くする��一部を切断して脚を短くする�２燭發靴覆ぁ修裡碍欧吠�け、無事にゴールの巣穴に戻れるか調べた。 （結果） その結果、竹馬を履き、歩幅が広がったアリは、ゴールを通り過ぎ、逆に短く歩幅が狭まったアリはゴール手前で立ち往生した。通常のアリはゴール付近で巣穴探しの行動をとった。脚の長さを変えたアリは慣れるにつれ、正確に巣に帰れた（。） （解釈） このことから、体内に歩数計を持つことが示唆された。（『読売新聞』２００６年６月３０日朝刊） 先日、Intronさん（本blogのリンク参照）とチャットで話した時に、話題になりました。 発想によっては、小学校の自由研究的な手法でも、世の中に新提案ができるだ！ と。 アマチュアアイエンティストのみなさん。みんなで 新薬開発シミュレーションやりませんか？ 私らみたいな立場の人間ががやれば、世の中に与えるインパクトは大ですよ！ |
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