論文を On line で投稿する際のシステムを参考に2006-11-03 Fri 23:40
私は、無料の新薬開発ソフト を世に出そうと 企画しています。
カテゴリ プログラマーのみなさんへ の過去記事 新薬開発ソフト：データアップロードのシステムを作りたいです で書いたことです。要点を 書きますと、 とりあえず 今からでも やれそうなこととして、 みなさんが設計した薬を、私の大学にある計算ソフトで 計算すればいい と考えました。 そのためには、皆さんが設計した薬データを 効率良く 受け渡し する必要があります。 そのシステムが作りたいです。 ホームページ上で、データをアップロードする形式にしたいです。 ユーザー登録したプレーヤーが、パスワードでlog inして、アップロードする。 こういうシステムは、論文をWebで投稿する際にも、用いられています。 投稿した研究者、編集者、レフェリー が pass word を入力して log-in して作業を進める方式です。 というわけで、このシステムの作り方をサイトを調べてみました。 ですが、いいサイトが見つかりません。 みなさん どうか 作り方について ご助言をくださいませ。 お願い致します。 いざとなったら、業者に相談します。 もう 起業だ 儲けだ なんて 関係なくなってきました！ とりあえず やります！ まずシステム作りです！ 粘ります！ やります！ うぉーーー。。  人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪    |
分子計算ソフト spartan06 のこと。2006-11-03 Fri 22:33
共同研究の関係で、 分子計算ソフト spartan06 （windows版） を研究室で買いました。
最近 06 にバージョンUPしたようです。 アカデミック版 Full edition １ユーザーライセンス で、約23万円 です。 USB型の 認証コードをPCにさすと 使えます。ソフトのインストール自体は、いくつのPCにしてもいいです。 分子の配座解析が 簡単にやれる点が このソフトの売りだ と私は考えています。 配座解析の計算が、分子力学法、半経験的分子軌道法、非経験的分子軌道法 でやることができます。 配座解析 というのは、 カテゴリ ゲームマニュアル；新薬設計のやり方 初級編 マニュアル 初級編 I-�� 薬（化合物）は 常に構造変化している ：こいのぼり が空で泳ぐようなイメージ の記事で説明したことと関係しています。 その記事では、次のことを話しました。 化合物は、こいのぼりが空で泳いでいる ような感じ で 構造変化 している。 構造が変化するからといって、全く別の化合物になるわけではない。 こいのぼりは、風を受けて形が変化するが、どんな形であっても こいのぼり である。 配座解析というのは、 風を受けている こいのぼり の１つ１つの形が、安定か不安定か？ を調べるための解析 と例えれば解り易いでしょうか。 風を受けている こいのぼり の形は、膨大数存在します。 膨大数ある形を、PCで自動的に作成して、その構造が持っているエネルギーを自動的に行います。 そのエネルギー値で、構造が安定か不安定か を判断します。 私は、計算化学ソフトを動かすOSとして、Linuxを使っていました。 しかし、spartan06 は Windows です。 なので、LinuxとWindowsが両方使えるPCを準備しました。 その作業中に、色々なトラブルがありました。 ・PCのCD-ROMドライブが壊れていて spartan06のインストールCD-ROMが読めなかった。→ 古いPCから ドライブの移植をして解決 （ぷぷっ笑。でも なかなか気付けませんでした） ・PCのハードディスクを増設して、そちらに Windowsをインストールしようとしたら、変になった。 → マザーボードに付属していたCD-ROMからドライブをインストールしたら良くなった。 （4年前に パソコン工房 で買ったPCで、カスタマイズしたやつでしたので こうなったようです。マザーボード付属のCD-ROMを探すのに 苦労しました。見つかって本当に良かった。笑） ・spartan06 の使い勝手の良さ・悪さ が解ってきた。 （予想外な問題点が浮上。今後の記事で 話します） 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
一昨日 論文を投稿しました2006-11-03 Fri 21:32
最近 Blogの更新が できずに 申し訳ありませんでした。
色々なことが 壁にぶつかっていました。 一昨日 論文を投稿しました。 題名は Why does influenza viral hemagglutinin take such a complicated shape ? です。審査結果が楽しみです。 論文のaccept、reject は重要ですが、 それよりもレフェリーのコメントが聞きたいです。 rejectな場合、どういうデータを足せばいいのか？ といったアドバイスが、得られるからです。 進展がありましたら、報告致します。 また、研究で使う spartan というソフトの インストール、予想外な不便さ に四苦八苦していました（汗 そのことは 次の記事で お話します。 人気blogランキングに参加してます。面白かったらクッリクを是非♪ |
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